Il commence a rechercher le Code de la Bible en 1992, après avoir rencontré le mathématicien israélien Eliyahu Rips et son associé Alexander Rotenberg, lors d'un voyage en Israël. À cette époque, Michael Drosnin n'est pas quelqu'un de religieux, s'avérant d'emblée être très sceptique à propos du Code de la Bible, qui serait contenu dans la version hébraïque de l'Ancien Testament : la Torah. Il devient convaincu de son importance en 1994, quand il découvre un code relatif au futur assassinat du premier ministre israélien Yitzhak Rabin dans la Bible. Il averti ce dernier, et devient persuadé de la capacité du code à prédire le futur quand Yitzhak Rabin est assassiné en 1995.
En 1997, Michael Drosnin publie son livre le plus connu, La Bible : le Code secret, dans lequel il affirme que le Code de la Bible, interprété à l'aide d'un logiciel d'ordinateur, prédit le futur et que ces événements pourraient être modifiés par nos actions. Son livre révèle par exemple que les assassinats de Anouar el-Sadate ou de John Fitzgerald Kennedy ont été annoncés par avance dans la Bible, plus de 3 000 ans auparavant. Des noms de personnages historiques tel que Saddam Hussein, Adolf Hitler, Albert Einstein apparaissent également, ainsi que des événements historiques comme la Grande dépression de 1929, l'Holocauste de la Seconde Guerre mondiale ou le premier pas de l'homme sur la lune lors de la mission Apollo 11 en 1969.
Il émet alors l'hypothèse qu'une intelligence extraterrestre (plutôt que Dieu) ait délivré le message codé de la Bible afin d'avertir les hommes de l'approche imminente de l'apocalypse, qu'il situe avec une très forte probabilité entre entre les années 1996 et 2006. Il évoque ainsi l'avènement prochain d'une nouvelle guerre mondiale déclenchée par un holocauste atomique, avec l'agression d'Israël comme élément déclencheur.
En 2002, il publie un deuxième livre sur le sujet : La Bible : le Code secret II - Le compte a rebours à commencé.
Un troisième livre, intitulé La Bible : le Code secret III - La Quête, est prévu pour 2008.
Le livre de Michael Drosnin est fondé sur la méthode dite de Séquence de lettres équidistantes (SLE) publiée en 1994 par les mathématiciens israéliens Doron Witztum, Eliyahu Rips, et Yoav Rosenberg dans la revue scientifique Statiscal Science. Cette méthode a été remise en cause par les mathématiciens Dror Bar-Natan et Brendan McKay, en l'appliquant au roman Guerre et Paix qui avait servi de contre-exemple aux israéliens.
Micheal Drosnin mit les critiques au défi de trouver un message relatif l'assassinat d'un premier ministre encodé dans Moby Dick. Brendan McKay, professeur de mathématiques à l’Université nationale d’Australie, a démontré que la méthode SLE pouvait s'appliquer à Moby Dick, trouvant neuf fois mentionné l'assassinat d'un premier ministre, mais aussi des allusions à l'assassinat de Martin Luther King ou à l'accident mortel de Lady Di.
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